リンクが切れていたので記事を修正しました。
簡単にできる方法が以下のWEBサイトに書いてありました。
コンソールでndk-buildしなくても、Androidツール->Add Native Supportを使うようです。
「古い NDK の環境設定の解説にはコマンド操作が書いて有ったりしてかえって混乱するので注意してください」
とあるように、古い情報だとはまることがあるので要注意です。
Android NDK の環境構築 : 時々、失業SEの開発日誌
また、以下のサイトでは、JNIでプログラムを書き始めるときの.hを作る方法が乗っています。
[Cygwin を使わない Android NDK 開発環境のインストールと使い方] by デジ太る